NCBI []
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指美国国立生命体核心技术讯息之前心
EMBL []
欧洲小分子生命体学测试室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）
DDBJ []
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年组织起来，是21世纪三大DNA 网络服务之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI网络服务协同组成国际DNA网络服务
CNGB []
之前国人国内网络服务（China National GeneBank）座落深圳大鹏原先区，是时隔21世纪三大网络服务此后的全21世纪第四大国内级网络服务。它是之前国人首个，也是唯一一个国内蛋白质库，比起全21世纪另外三个蛋白质库而言，国内蛋白质库容器完好的规模、存储量和可回访的图表量皆是全21世纪最大。
BIGD []
之前国人国内蛋白质组科学研究网络服务 生命与健康大网络服务 (National Genomics Data Center BIG Data Center)
2、非字节RNA网络服务（1）.非字节小RNA网络服务miRBase []
piRNAbank []
piRNAbank []
SILVA []
（2）.长非字节RNA网络服务：LncRNAdb []
真核生命体
LncRNAwiki [_Page]
人类长非字节RNA网络服务
（3）.非字节RNA家系网络服务Rfam[]
值得注意Pfam的RNA家系译文网络服务
（4）.非字节RNA脱氧核糖核酸网络服务RNAcentral [ ]3、抗原质网络服务（1）.抗原质讯息Human protein atlas [ ]
体内抗原在蛋白质、的组织、病理前提条件下的表达出来
（2）.抗原脱氧核糖核酸网络服务Pfam []
Pfam是抗原质家系的网络服务，有数用到隐逻辑系统仿真降解的译文和多脱氧核糖核酸核对。
SwissProt []
手动译文的非冗余抗原脱氧核糖核酸网络服务
UniProt [ ]
PIR []
Antibodies []
BRENDA [ ]
HPRD []
InterPro []
通过整合多个抗原方面网络服务，提供了一个方便的对抗原脱氧核糖核酸来进行功用译文的平台，有数对抗原质家系、构造域、功用位点的得出
iProClass []
PRF []
REBASE []
（3）.抗原质构造网络服务PDB []
通过测试测由此可知的构造
SCOP []
CATH []
PSI []
（4）.抗原组网络服务PRIDE []（5）.抗原质功用域网络服务PROSITE []
最全面
Pfam []
最专业人士
ProDom []
CCD []
Prints []
SMART [ ]
TIGRFAM []
（6）.抗原互作网络服务STRING []
DIP []
测试测试的抗原相互功用网络服务
BioGRID [] ：
IntAct [ ]
4、代谢物网络服务MapMan：一个图形用户界面的代谢物途径查看和编辑软件
（1）.代谢物途径网络服务KEGG []
GO []
NCBI BioSystems []
IMP []
plantCyc []
MANET [ ]
MetaNetX [ ]
（2）.代谢物组学常用网络服务MataboLights []
HMDB []
YMDB []
ECMDB []
（3）.表型网络服务Planteome []
dbGaP []
IPPN []
5、脱氧核糖核酸核对（1）.脱氧核糖核酸与网络服务核对Blast []（2）.多脱氧核糖核酸在在核对Clustal（3）.脱氧核糖核酸进化树核对MEGA6、蛋白质核对（1）.蛋白质讯息GeneCard []
Gene Wiki[_Wiki ]
（2）.蛋白质译文Blast []
Interproscan []，
WEGO []
KAAS []
（3）.蛋白质功用得出：FGENESH []
AUGUSTUS [ ]
GENESCAN []
GeneMark []
Glimmer []
（4）.蛋白质构造得出Exon-Intron Graphic Maker []
根据候选蛋白质的外显子和原核生物等讯息绘出蛋白质构造
Blastp [_TYPE=BlastSearchAndrewLINK_LOC=blasthome]
可网络服务获取抗原构造域的译文和位置讯息
（5）.分化成蛋白质核对OrthoDB是直系分化成可作的示范网络服务[]（6）.亚蛋白质适配得出PSORT Prediction []（7）.亨因表达核对Plantcare []（8）.抑制用意蛋白质的miRNA得出psRNAtarget []（9）.表达出来核对ArrayExpress [ ]
图表来自EMBL的高通量功用蛋白质组学测试的图表；
BAR []
在核对蛋白质功用时，多半会参照蛋白质的表达出来方式将上，即蛋白质在植可作各有不同的组织各有不同胚胎之前期的表达出来丰度变化。通过网络服务核对的网站BAR对候蛋白质来进行表达出来核对。 是一个植可作生信核对水资源的网站，用该的网站核对蛋白质表达出来时，不仅可以取得蛋白质表达出来方式将上的热图，还可以取得三维的自由电子发射光谱图像，直观呈现蛋白质在植可作的组织之前的表达出来位置。
（10）.蛋白质构造绘出GSDS []
Gene Structure Display Server，亨于蛋白质组译文文件绘出脱氧核糖核酸蛋白质构造等功用
7、抗原质核对（1）.抗原二级三级构造得出及绘图CFSSP []SOPMA [_automat.pl?page=npsa_sopma.html]PredictProtein []SWISS-MODEL []（2）.抗原属性核对ProtParam []
抗原属性核对是指抗原的一些可作理和化学常量，如小黏度、等电点、和原子组成、消光下式、半衰期、不稳由此可知下式、脂肪族指数、绿地性。这些常量，有助于来进行抗原的方面机械人测试。比如在体内内体系（病原、蜂蜜等）表达出来和纯化用意抗原时，需考虑抗原的小黏度、等电点、消光下式、不稳由此可知下式和绿地性等。在酶光阴测试之前，也需根据这些常量优化测试体系。
（3）.抗原一视同仁常核对Protscale []
抗原的一视同仁常主要由其侧链亨团R，如果R只是H或是C、H两属性组成的话，都是疏水的，如果含有极性侧链亨团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（绿地的）。疏常有赖氨酸、乙酰、苯羧酸、赖氨酸、氨亨酸、异氨亨酸、羧酸和蛋氨酸（甲硫氨酸）。疏常在抗原质内部，在保持抗原质的三级构造上，酶和蛋白质质、免疫和抗原在在的相互功用等各种非共价键的小分子结合方面，具有举足轻重功用。
（4）.包涵凝胶构造核对TMHMM []
抗原的包涵凝胶构造核对对于得出抗原的亚蛋白质适配密切方面。如果具有包涵凝胶构造，抗原很可能会适配于蛋白质之前与凝胶方面的构造，如蛋白质质凝胶、真核细胞凝胶或蛋白质质凝胶等内凝胶系统。此外，抗原包涵凝胶构造核对对于抗原功用核对也有一由此可知的帮助。比如某抗原没有包涵凝胶构造，但是亚蛋白质适配测试显示其可适配于凝胶方面构造，这所述该抗原可能会通过其他凝胶适配抗原召募过去的。
（5）.讯号肽核对SignalP []
山峰讯号位置为讯号肽整块点，山峰之前的脱氧核糖核酸为讯号肽
讯号肽是指指引原先合成的抗原质向排泄通路移转到的细肽链，常座落抗原的N-两端，专责把抗原质指引到各有不同凝胶构造的亚蛋白质器内。字节排泄抗原的mRNA在译文时首先合成N两端的讯号肽，它被讯号肽辨别抗原(SRP)所辨别，SRP将核酸带上至核酸上，核酸凝胶上的 SPR 激素辨别并与之结合。原先合成抗原在讯号肽指引下出发核酸内凸，而讯号肽则在讯号肽酶的功用下被切除。由于它的指引，原先生的就能够通过核酸凝胶进入凸内，再次被排泄到胞外。在宿主孢子之前表达出来特罗斯季亚涅齐抗原时，可用讯号肽指引特罗斯季亚涅齐抗原适配排泄到胞外，降低抗原可溶性，在真核生可作表达出来系统（病原、芽孢孢子等）和真核表达出来系统（如毕秃蜂蜜）之前均有应用。
（6）.磷酸化位点核对NetPhos []
KinasePhos-2.0 []
抗原质磷酸化指由抗原质赖氨酸催化的把 ATP 的磷酸亨移转到确实可作抗原质亚亨（赖氨酸、苏氨酸、赖氨酸）上的操作过程，或者在讯号功用下结合 GTP（多半以 GTP 取代 GDP），是生命体体内一种比如说的调节方式将，在蛋白质讯号转导的操作过程之前起举足轻重功用。在讯号达到时通过取得一个或几个磷酸集团而被抑制，而在讯号移向时是去除这些集团，从而耗尽光阴性。有时某个讯号抗原磷酸化多半造成下游的抗原左至右发生磷酸化，转变成磷酸化种系统反应。
二、生命体讯息学软件及下载绑定：
Clustal:
MEGA:
MAFFT:
Sequence Matrix:
PGDSpider:
DnaSP v6:
Arlequin:
MapMan：
PartitionFinder:
jModelTest:
IQ-TREE:
IQ-TREE网络服务:
RaxmlGUI:
Mrbayes 3.2.7:
PhyloSuite:
BEAST:
Figtree:
Tracer:
PopART:
Network:
Structure:
CLUMMP:
Distruct:
Migrate-N:
Phylonet: 或
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