Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的发挥作用

2021-10-13 17:19:07 来源:
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导言:在早期阶段,生物体就开始了在不忽略病原体细胞会DNA组织先后顺序的前提很久使其DNA发挥不同的功能,而这就是通过给DNA亚基上添加化学上面来实现的。DNA苯基化是灵长类的关键表型表现型系统,其中所5-苯基胞嘧啶(5mc)是最常用的DNA剪裁之一。6mdA是病原体与此相反剪裁系统的基本上组成成分,以外在灵长类中所缺乏已知的与此相反剪裁系统。早先有不少学术研究报道,6mdA也共存于灵长类中所,但并已对支持。

昨日,在《医学令人满意》上的一项学术研究中所,瑞典林雪平国立大学的学术研究部门说道明了,灵长类细胞会中所共存病原体表型表现型上面很可能被饮用水了,并且没有人足够的证据来证明灵长类中所共存这种剪裁。

N6-苯基腺嘌呤(6mdA)是病原体中所广泛的DNA剪裁,但最近在灵长类DNA中所也获得了表征。然而,学术研究部门曾说道,即使对来自相同灵长类细胞会类别的DNA进行的6mdA能谱和丰度测学术研究也不一致。

为了再进一步揭示6mdA在灵长类代人XT中所的主导作用,学术研究部门利用了游离将有机体幼稚T专用(NTH)细胞会分立为TH细胞会亚群的能力。但是,与早先的学术研究相反,他们注意到TH分立每一次中所6mdA的丰度没有人全局变化,并且掩蔽到分立的T细胞会中所的6mdA高度与未苯基化的全遗传物质增为DNA相同,这说道明了6mdA并未以可检验的高度共存有机体T细胞会中所。

他们还分析了从六个有机体细胞会系中所提取的DNA中所的6mdA,并检验出两个不具备大于背景噪声高度的6mdA高度的细胞会系。意想不到的是,两种单独的293T细胞会系培养物不具备不同的6mdA高度,这说道明了学术研究部门掩蔽到的6mdA接收器并非细胞会类别本身固有的。确实,当他们再进一步看时,他们注意到两条6mdA高度升高的细胞会系被支原体旧称饮用水,支原体旧称一种常用的病原体细胞会培养物中所富含6mdA的饮用水物。当他们用支原体甲基化青霉素Plasmocin处理细胞会系时,6mdA接收器减少为WGA复数折衷。

“我们意识到通过这些关键技术检验到的6mdA'接收器'只是噪声。但是,由于一些多样的关键技术疑问,几种分析方法中所的背景噪声不是随机的,而是真实接收器。”高级作者Colm Nestor(科尔迈·内斯特)在一份声明中所说道。

学术研究部门分析了以前通过DNA免疫沉淀有机体遗传物质计划、质谱和单分子实时有机体遗传物质计划在灵长类细胞会中所取向或检验6mdA的努力。人们注意到每种分析方法都有显然或瑕疵,使表型表现型上面的所谓阳性注意到率极高,也许说道明了林雪平学术研究部门认为不共存这种周期性的证据。

这组作者曾说道:“我们证明,RNA和病原体饮用水、免疫横向反应性和其他关键技术限制的结合已造成了6mdA在灵长类DNA中所的反复偏差识别。随着DNA和RNA剪裁堂兄弟的急剧激增,以及以前未知剪裁的大大的日渐罕见,即使常用多种表征分析方法,我们也凸显了偏差注意到的可能性。我们同意常用剪裁和未剪裁的遗传物质DNA规范作为今后对比较丰富DNA剪裁的学术研究的大于要求,以及在常用前来得全面地检验免疫甲基化。”

内斯特必需说道,学术研究部门在学术研究颇为罕见的周期性时必须颇为小心,同样常用哪种分析方法,并考虑他们是否真正在衡量共存的任何事物。他说道:“现在我们可以毫无疑问地说道灵长类中所不共存6mdA。关于6mdA,如果学术研究部门停止学术研究根本不共存的东西,则可以节省大量整整和金钱,并且避免了很多令人失望的一定会。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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